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* 通讯作者：Jinbo Xu, jinboxu@moleculemind.com 参考文献 [1] Joseph L Watson, David Juergens, Nathaniel R Bennett, Brian L Trippe, Jason Yim, Helen E Eisenach, Woody Ahern, Andrew J Borst, Robert J Ragotte, Lukas F Milles, et al. De novo design of protein structure and function with rfdiffusion. Nature, 620 (7976):1089–1100, 2023. [2] Martin Pacesa, Lennart Nickel, Christian Schellhaas, Joseph Schmidt, Ekaterina Pyatova, Lucas Kissling, Patrick Barendse, Jagrity Choudhury, Srajan Kapoor, Ana Alcaraz-Serna, et al. One-shot design of functional protein binders with bindcraft. Nature, 646 (8084):483–492, 2025. [3] Vinicius Zambaldi, David La, Alexander E Chu, Harshnira Patani, Amy E Danson, Tristan OC Kwan, Thomas Frerix, Rosalia G Schneider, David Saxton, Ashok Thillaisundaram, et al. De novo design of high-affinity protein binders with alphaproteo. arXiv preprint arXiv:2409.08022, 2024. [4] Chai Discovery Team, Jacques Boitreaud, Jack Dent, Danny Geisz, Matthew McPartlon, Joshua Meier, Zhuoran Qiao, Alex Rogozhnikov, Nathan Rollins, Paul Wollenhaupt, et al. Zero-shot antibody design in a 24-well plate. bioRxiv, pages 2025–07, 2025. [5] Luis S Mille-Fragoso, John N Wang, Claudia L Driscoll, Haoyu Dai, Talal Widatalla, Xiaowei Zhang, Brian L Hie, and Xiaojing J Gao. Efficient generation of epitope-targeted de novo antibodies with germinal. bioRxiv, 2025. [6] Hannes Stark, Felix Faltings, Min Gyu Choi, Yuxin Xie, Eunsu Hur, Timothy O’Donnell, Anton Bushuiev, Talip Uçar, Saro Passaro, Weian Mao, et al. Boltzgen: Toward universal binder design. bioRxiv, pages 2025–11, 2025. [7] BioGeometry Team and Jian Tang. Rapid de novo antibody design with geoflow-v3. bioRxiv, pages 2025–10, 2025. [8] Sheng Xu, Qiantai Feng, Lifeng Qiao, Hao Wu, Tao Shen, Yu Cheng, Shuangjia Zheng, and Siqi Sun. Foldbench: An all-atom benchmark for biomolecular structure prediction. bioRxiv, pages 2025–05, 2025. [9] Josh Abramson, Jonas Adler, Jack Dunger, Richard Evans, Tim Green, Alexander Pritzel, Olaf Ronneberger, Lindsay Willmore, Andrew J Ballard, Joshua Bambrick, et al. Accurate structure prediction of biomolecular interactions with alphafold 3. Nature, 630 (8016):493–500, 2024. [10] Helen M Berman, John Westbrook, Zukang Feng, Gary Gilliland, Talapady N Bhat, Helge Weissig, Ilya N Shindyalov, and Philip E Bourne. The protein data bank. Nucleic Acids Research, 28 (1):235–242, 2000. [11] Claudio Mirabello and Björn Wallner. Dockq v2: improved automatic quality measure for protein multimers, nucleic acids, and small molecules. Bioinformatics, 40 (10):btae586, 2024. [12] Saro Passaro, Gabriele Corso, Jeremy Wohlwend, Mateo Reveiz, S. Thaler, Vignesh Ram Somnath, Noah Getz, Tally Portnoi, J. Roy, Hannes Stark, D. Kwabi-Addo, Dominique Beaini, Tommi Jaakkola, and Regina Barzilay. Boltz-2: Towards accurate and efficient binding affinity prediction. bioRxiv, pages 2025–06, 2025. [13] ByteDance Seed. Protenix-v2: Broadening the reach of structure prediction and biomolecular design. 2025. [14] ByteDance AML AI4Science Team, Xinshi Chen, Yuxuan Zhang, Chan Lu, Wenzhi Ma, Jiaqi Guan, Chengyue Gong, et al. Protenix—advancing structure prediction through a comprehensive alphafold 3 reproduction. bioRxiv, pages 2025–01, 2025. [15] Salvatore Candido et al. Language modeling materializes a world model of protein biology, 2026. URL https://github.com/biohub/esm. Biohub preprint. [16] Ivan Anishchenko, Samuel J Pellock, Tamuka M Chidyausiku, Theresa A Ramelot, Sergey Ovchinnikov, Jingzhou Hao, Khushboo Bafna, Christoffer Norn, Alex Kang, Asim K Bera, et al. De novo protein design by deep network hallucination. Nature, 600 (7889):547–552, 2021. 附录 A 设计 VHH 序列针对已知抗体数据库的 CDR 相似性分析 为评估设计序列相对于已知抗体序列的新颖性，我们对 338 个 VHH 序列进行了 CDR 相似性分析，涵盖 11 个靶标系统，并额外检查了每个系统中亲和力最高的 VHH 候选物。

4、为什么有人爱到最后，只剩下一句“别让我成为你的又一个过客”？_网易订阅

而嫌疑人得手后，立刻找借口仓皇离开。

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6、英媒：梅西点球水平远不及凯恩和C罗，阿根廷应考虑更换主罚人选

专家同时提醒，老年人群，体重超标人群，常年有慢性病、免疫力较差的朋友，属于重症高风险群体。

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7、深度伪造，怎么破？

研究论文《Flexibility-Aware Geometric Latent Diffusion for Full-Atom Peptide Design》已被 ICML 2026 接收，将亮相第 43 届国际机器学习大会。

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8、四川除冰机器人亮相2026世界人工智能大会 科技赋能破解高原线路覆冰运维难题

近年来，成都人工智能产业加速起势。

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9、又一批医学院“放话”，冲击升格医科大学！

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2025年11月，南开大学校长陈雨露（左一）与南开大学终身校董、南开校友企业家联谊会主席、物美集团创始人张文中（右一）共同为约书亚・扎尔颁发第二届南开大学数学人才奖 本届国际数学家大会上两位中国数学家荣获菲尔兹奖，这一历史性突破成为近年来中国数学快速崛起的生动写照。

10、克洛普出任德国男足国家队主教练

供需关系持续收紧，预计蛋价继续抬升，预计月末高点上行至5.20-5.30元/斤，月均价4.90元/斤。

工作人员当即和翁女士视频连线，一步步指导她通过线上渠道完成养老保险补缴。

1、东北超有礼丨延边‌⇄大连，赛前互传书信

彭敏说：“诗词是中国人共有的精神根脉，是通用的情感语言。

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3、斯基拉丨米兰即将与卡马尔达续约至2031年

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4、李昊首秀！韦世豪担任队长，国足对阵新加坡首发出炉，武磊替补

【中国海警驱离菲公务船视频公布】7月23日，菲律宾3012、3018两艘公务船不顾中方一再劝阻和警告，执意侵闯中国黄岩岛管辖海域。

5、月收入快18个亿，每天接诊超4万人，全球最大的医院竟然在中国

换句话说，青羊需要一个能将“五边形”补齐为“六边形”的关键落子。

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7、探访大理大学的荷花校区，感受其周边夜市和美食街里的青春烟火味

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1983年9月，进入北京武术队，1988年，主演第一部电影《奇情侠侣》。

8、38岁劳森偷酒被捕！早有违法前科多次犯事 离开NBA后曾效力CBA

”不到10天后，口径再度反转，据新华社报道，美国已通知以色列，计划在未来数日加大对伊朗的打击力度，甚至可能动用重型轰炸机，按照以色列媒体的说法，该机可能用于打击伊朗“镐山”的疑似地下核设施。

机上乘客原以为很快就能重新起飞，结果却被困在机舱，度过了一整夜。

站在纬一路从外侧看木荷苑小区北门 居民指着“三道槛”向帮忙君表达了自己的忧虑： 这道金属栅栏门是阿拉小区的消防门，是需要满足消防车通行的，现在这种情况，消防车和其他紧急救援车辆还能出入吗？ 而结香苑的情况与木荷苑如出一辙。

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